文章目录

1 资料与方法

1.1 数据获取及数据预处理

1.2 差异基因的识别

1.3 Cmap筛选药效作用相似的化合物

1.4 基因共表达网络构建

1.5 基因模块的识别

1.6 GO富集分析

1.7 蛋白互作网络（PPI）构建

1.8 HUB基因识别

1.9 DisGeNet数据库验证HUB基因

2 结果

2.1 质控分析

2.2 差异基因的识别

2.3 Cmap数据库分析相似化合物

2.4 基因共表达网络分析

2.5 GO富集分析

2.6 HUB基因的识别

2.7 DisGeNet数据库验证HUB基因

3 讨论

文章摘要:目的：结合高通量转录组测序技术提出一种中药药理机制分析方法，并以金花清感颗粒为例探究其发挥药效作用的关键机制。方法：对中药作用于细胞系进行高通量转录组测序，获得中药作用转录组表达谱；设计一种基于基因共表达网络的生物信息学分析技术，即依次进行差异表达基因的识别、药效作用相似化合物的筛选、基因共表达网络的构建、基因模块的识别、GO富集分析、蛋白互作网络的构建、 HUB基因的识别、 HUB基因的验证。利用以上方法分析金花清感颗粒的药理机制。结果和结论：通过该方法发现金花清感颗粒对于新冠肺炎（COVID-19）患者具有治疗作用，且对病毒感染后血小板脱颗粒、血液高凝状态引起的多器官氧化应激损伤具有潜在的治疗修复作用，为进一步阐明金花清感颗粒的作用提供了证据。该方法适用于大多数中药药理机制的分析，为中医药现代化研究提供了方法学支撑。

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